ImageJは6で紹介したソフトウエアです。
その他の機能はここ(英語のページ)も参考にしてください。
データは2Dでなく3Dで計測されます。DICOMで出力された複数枚の2D画像をstackで一つの3Dデータにし、そあとz-projection(z投射)を行います。
①ImageJでTOF( Time of Flight)シーケンスで計測されたMRAデータの2DのDICOM画像全てをopenから開きます。(MRIcroGLなどで3Dのnifty形式に変換しておくことをお勧めします)
②開いている2DデータをImage→Stacks→Image to Stackで一つにします。
③Image→Stacks→ 3D projectで開いた3D ProjectionウインドからProjection methodをBrightest Point(MIPに相当)、回転軸(axis of rotation)を選択、あとは既定のまま、OKで進みます。これで終了です。下のバーをスライドさせると回転させることができます。
MRAの方向を変えるには、Resliceを行います。
①Axialで計測されているデータをCoronalに変換：Stacks→Reslice：Rotate 90 degree/OK
②回転したデータを指定して再度3D projectionで回転させる。